História da Fapesc
A história da Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina tem início em 5 de junho de 1990 quando foi instituído o Fundo Rotativo de Fomento à Pesquisa Científica e Tecnológica do Estado de Santa Catarina (Funcitec).
O Funcitec era um fundo contábil cujas diretrizes eram estabelecidas pelo Conselho de Política Científica e Tecnológica do Estado de Santa Catarina.
Já em 1997, com a Lei 10.355, Santa Catarina passou a contar com a Fundação de Ciência e Tecnologia, mantendo a sigla Funcitec.
O nome Fapesc surgiu pela primeira vez em 28 de fevereiro de 2005 com a sanção da Lei Complementar nº 284, que transformou a Fundação de Ciência e Tecnologia (Funcitec) em Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica do Estado de Santa Catarina (Fapesc).
Após seis anos, com a Lei Complementar nº 534, de 20 de abril de 2011, surgiu a denominação utilizada até os dias atuais: Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina, incorporando a Inovação entre os programas fomentados pela Fapesc.
Em 8 de maio de 2012 o atual estatuto social da Fapesc foi aprovado pelo Decreto 965/2012.
Atualmente a Fapesc está vinculada à Secretaria de Estado do Desenvolvimento Econômico Sustentável (SDE) e tem papel fundamental dentro do ecossistema de Ciência, Tecnologia e Inovação (CTI) de Santa Catarina conforme Lei Complementar 741 de 12 de junho de 2019.
Em 2020, a Fapesc atualizou sua identidade visual incorporando a Inovação também ao seu material visual.
A nova logomarca da Fapesc traz, inclusive, a Inovação como inspiração. Seus traços são baseados em cromossomos que se juntam até formar a imagem do cérebro humano.
Sua missão foi se consolidando ao longo dos anos, sempre buscando promover o ecossistema catarinense de Ciência, Tecnologia e Inovação por meio de fomento e da integração de seus agentes, objetivando o avanço de todas as áreas do conhecimento, o equilíbrio regional, o desenvolvimento econômico sustentável e a melhoria da qualidade de vida do cidadão catarinense.
Em 2022, a Fapesc chega aos 25 anos de existência sendo a Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação dos catarinenses.
Linha do Tempo
Quadro de presidentes Funcitec e Fapesc
| Presidentes | Início | Fim |
| Neri dos Santos | 27/01/1997 | 22/09/1997 |
| Francisco Afonso E. Vieira | 29/09/1997 | 31/12/1998 |
| Honorato Antônio Tomelin | 01/01/1999 | 05/04/2002 |
| Paulo de Tarso Mendes Luna | 03/05/2002 | 31/12/2002 |
| Antônio Diomário de Queiroz | 31/01/2003 | 15/03/2005 |
| Rogério Silva Portanova | 28/03/2005 | 29/03/2006 |
| Vladimir Álvaro Piacentini | 03/01/2007 | 16/04/2007 |
| Antônio Diomário de Queiroz | 16/04/2007 | 01/01/2011 |
| Sérgio Luiz Gargioni | 03/01/2011 | 31/12/2014 |
| Sérgio Luiz Gargioni | 01/01/2015 | 12/09/2018 |
| Gilberto Luiz Agnolin | 12/09/2018 | 01/01/2019 |
| Fábio Zabot Holthausen | 03/01/2019 | atual |
